ルート上の様々なエリアを辿りながら自機・僚機の強化を行い、最奥に待ち受けるボスの撃破を目指す新CPUモードです。
本モードではバトルの報酬やショップエリアでカスタムチップを入手して自機・僚機を強化が可能!入手したカスタムチップをチューニングしてさらに強化することもできます。
バトルで消耗した戦力ゲージは補給基地エリアで回復できます。どのルートを進むかが攻略の鍵となるので、慎重にエリアを選択していきましょう!
マップはプレイするたびにランダムに生成され、さらに難易度も豊富に用意されているので、長く遊び込めるやりごたえのあるモードです。